Langsung ke konten

Pohon kekerabatan hantu Nusantara

Filogeni hantu, secara harfiah.

Bukan kiasan. Kuntilanak, pocong, tuyul, dan 163 roh lain dari Nusantara dinilai seperti spesimen museum berdasarkan 20 sifat, lalu IQ-TREE menyimpulkan pohon kekerabatannya dengan metode kemungkinan maksimum yang sama yang dipakai ahli biologi untuk makhluk hidup apa pun, dari bakteri, tumbuhan, hingga manusia.

hantu Indonesia
152
sepupu kelompok luar
14
karakter berkode
20
wilayah kepulauan
8

Empat pintu masuk

Tiga cara membaca pohon yang sama, dan satu untuk semua hal lain dalam data. Setiap hantu juga punya halaman spesimennya sendiri.

Kekerabatan terkuat

Klad kecil dengan ultrafast bootstrap 90 atau lebih. Sebagian besar bagian dalam pohon belum terpecahkan: hanya 4 dari 119 simpul yang mencapai 95.

Cara pohon disusun

  1. Urai

    Membaca 166 takson dari set data serta merapikan nama, klad, dan wilayah.

  2. Kodekan

    Menulis matriks morfologi 166 × 20 dalam format Nexus.

  3. Simpulkan

    IQ-TREE 2.3.6 memilih MK+FQ+ASC+R2 dan menjalankan 1000 ultrafast bootstrap.

  4. Terbitkan

    Mengakarkan pohon pada kelompok luar, menggambar pelat untuk setiap hantu, dan membangun situs ini.

Setiap perubahan pada data menjalankan ulang keempat langkah ini dalam alur kerja GitHub. Baca metodenya.